Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA11P31270 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA11P31270 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms