Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA9P31269 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA9P31269 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms