Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSPOP30536 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSPOP30536 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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