Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A5P29400 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms