Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms