Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD34P28906 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD34P28906 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD34P28906 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD34P28906 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD34P28906 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD34P28906 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD34P28906 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD34P28906 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms