Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRNP28799 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRNP28799 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRNP28799 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRNP28799 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRNP28799 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRNP28799 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRNP28799 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRNP28799 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRNP28799 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms