Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms