Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms