Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALB2P22676 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALB2P22676 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALB2P22676 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALB2P22676 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALB2P22676 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALB2P22676 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALB2P22676 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALB2P22676 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CALB2P22676 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CALB2P22676 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CALB2P22676 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms