Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC9A1P19634 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC9A1P19634 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms