Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPI1P17947 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms