Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPCAMP16422 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms