Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFAP15692 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFAP15692 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms