Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRG2P13727 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRG2P13727 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRG2P13727 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRG2P13727 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRG2P13727 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms