Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMP1P11279 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms