Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCF2P10911 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCF2P10911 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCF2P10911 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms