Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms