Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms