Protein–RNA interactions for Protein: O95390

GDF11, Growth/differentiation factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF11O95390 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF11O95390 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF11O95390 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF11O95390 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF11O95390 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF11O95390 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF11O95390 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF11O95390 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF11O95390 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF11O95390 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms