Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOL3O95236 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOL3O95236 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms