Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN1O94985 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms