Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITX3O75364 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITX3O75364 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX3O75364 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX3O75364 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITX3O75364 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms