Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND1O60716 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms