Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMPRSS11DO60235 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms