Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXA3O43365 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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