Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CRXO43186 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CRXO43186 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CRXO43186 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRXO43186 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms