Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARPC1BO15143 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms