Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3EO15041 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms