Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRTO14522 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRTO14522 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRTO14522 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
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