Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms