Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVH48-1M5A8F1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVH48-1M5A8F1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms