Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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