Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms