Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRRM5B3KS81 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms