Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ODF3BA8MYP8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms