Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L4A6NEF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms