Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00862A6NCI5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms