Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms