Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSDA5PKW4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSDA5PKW4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms