Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A0A0U1RQF3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A0A0U1RQF3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms