Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms