Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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