Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC012464.3-201ENST00000604017 2773 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 PIEZO2-204ENST00000538948 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TRHP20396 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 GAD1-217ENST00000625689 3700 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01278-205ENST00000609401 2886 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms