Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-2B6SEH9 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms