Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SIX1Q15475 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SIX1Q15475 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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SIX1Q15475 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SIX1Q15475 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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