Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CACNA1SQ13698 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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