Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SHOC2Q9UQ13 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms