Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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USP31Q70CQ4 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
USP31Q70CQ4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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