Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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